Tous les êtres vivants présentent un point commun : ils sont tous formés d'éléments microscopiques appelés cellules. Toutes les cellules (animales ou végétales) ont la même organisation. Elles sont formées par du cytoplasme, elles sont entourées par une membrane et elles renferment un noyau. On peut commencer par observer sous microscope les cellules d’oignon qui sont jointives et imbriquées comme les briques dans un mur.
Pour la tomate, elle est aussi constituée de cellules végétales, mais elle est en plus rouge.
Pour cela, on ouvre une tomate en deux et on prélève avec la pointe d'un couteau un tout petit peu de gelée à proximité des graines qu’on dépose entre lame et lamelle et on observe sous microscope. On observe de très grandes cellules contenant un petit noyau ainsi que des cristaux d'un pigment rouge. C’est le lycopène . Pigment donnant sa couleur à la tomate rouge, au melon d'eau et au pamplemousse rose la gélification de la paroi de ces cellules au cours de la maturation du fruit qui constitue la "gelée" située entre les graines.